基本要素
| 座標軸 |
 座標軸は右図のようになっています。左右がX軸、上下がY軸、奥行きがZ軸で、色はそれぞれ赤、緑、青に統一されています。 |
| ドキュメント |
| ドキュメントはオブジェクト、視点、材質などの情報を管理します。 Metasequoiaは１つのウインドウで１つのドキュメントを扱います。複数のドキュメントを編集するには複数のMetasequoiaを起動する必要があります。使用バージョンが同一である場合は、メニュー上の［切り取り］［コピー］［ペースト］を使えば、相互にデータをやりとり出来ます。 |
| オブジェクト |
 １つのドキュメントは複数のオブジェクトを扱うことが出来、オブジェクトパネル上では、いわゆるレイヤーのような操作が出来ます。オブジェクトの形状を構成する要素は、頂点・辺・面の３つです。面は表裏がある片面で、裏側からは見えません。使用できる面は三角形か四角形のみであり、多角形は扱えません。 |
| 材質 |
| オブジェクトの面には材質を指定できます。材質を指定することにより、色やマッピング画像が表示されます。材質を割り当てていないと、未着色面として扱われます。 材質の設定は材質パネル上で行います。 |
| マッピング画像・ＵＶ値 |
| 材質にはマッピング画像を指定でき、面に模様や凸凹感を与えることにより質量感のあるものが出来ます。面にはUV値という属性があり、それによりマッピング画像のどの部分を貼り付けるかを設定できます。UV値は［ＵＶ操作］コマンドで展開図上で編集します。 材質へのマッピング画像の指定は材質パネル上で行いますが、その画像に対してはペイントパネル上で編集することができます。また、［ペイント］コマンドにより３Ｄ画面上で直接描いていくことも出来ます。  |
| ワールド/スクリーン座標/ローカル座標 |
 ［移動］などいくつかのコマンドでは、コマンドパネル上の編集オプショングループ内[L]［W］［S］を切り替えることによってワールド・スクリーン・ローカル座標系での操作を指定することが出来ます。ワールド座標系は原点から表示されている軸に沿った操作を行い、スクリーン座標系は見た目での縦横方向への操作を行います。ローカル座標はオブジェクトごとに基点と向きを持たせるもので、[ローカル]コマンドで設定した後、[移動]コマンドなどで傾けた軸に沿った編集操作を行うことが出来ます。  |